Российский фонд фундаментальных исследований
Министерство образования и науки Российской Федерации
Пущинский научный центр РАН
Пущинский государственный естественно - научный институт
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
Цель конференции:
Прогресс в развитие вычислительной техники в конце 20-го и начале 21 века внес в биологию принципиально новые возможности исследований, основанные на компьютерных технологиях работы с объектами. К ним относится: получение, обработка, анализ, классификация и распознавание биологических объектов на основе их электронных изображений. Появилась компьютерная биология, как наука, оперирующая электронными изображениями - образами (имидж) биологического объекта. Работа с образами биологических объектов – фундаментальное отличие компьютерной биологии от биоинформатики и математического моделирования биологических процессов.
В течение 200 лет развития биологии, проблема создания изображений живых биологических объектов была одним из самых «узких» мест. Невозможность сохранения и дальнейшего анализа изображения мешало полному переходу биологии на адекватное математическое описание её объектов. С появлением цифровых имиджей биологических объектов биология делает решительный шаг на пути «от слов к цифре», что означает новый период во взаимоотношениях биологии и математики.
Принципиальным новшеством является возможность создания имиджей живых биологических объектов, что открывает перспективу неинвазивной работы с биологическим объектом. Это выводит биологию на качественно новый уровень исследований, за счет анализа и обработки изображений и распознавания живых объектов. Важнейшим компонентом компьютерной биологии становится анализ изображений. Разработка и применение различных софтов для анализа одного и того же изображения – наиболее надежный путь верификации полученных данных.
Одним из перспективных подходов в решении этой задачи являются методология создания и распознания виртуальных образов, которая плодотворно разрабатывается во многих российских математических школах.
Формат конференции:
Настоящая конференция ставит своей задачей «встречу» биологов и математиков для определения уровня современных исследований и обсуждению проблем, стоящих перед биологами по исследованию изображений. Организация работы конференции предполагает не только заслушать доклады ведущих специалистов, но и провести мастер-классы, в ходе которых:
- биологи представят первостепенные задачи компьютерной биологии, при создании, обработке, анализе и хранении изображений биологических объектов.
- разработчики различных программ смогут продемонстрировать их возможности перед потенциальными партнерами-заказчиками из различных областей компьютерной биологии;
Основные вопросы, планируемые для обсуждения:
- Основные задачи компьютерной биологии: разработка и стандартизация процедур создания изображений.
- Определение круга проблем при работе с «плоскими» и трехмерными объектами.
- Методы и модели представления биологической информации.
- Математическая теория получения, обработки, анализа, распознавания и понимания изображений биологических объектов.
- Машинная графика и визуализация в компьютерной биологии.
- Алгоритмические, программные и технические средства обработки биологической информации.
- Распознавание образов в компьютерной биологии.
- Методы хранения биологической информации и организация её цифровых архивов.
- Методы поиска биологических изображений по заданным признакам.
www.bio-comp.info